1993 fue fundada el 18 de enero, y luego el 28 de octubre de 1998, fue clasificada como Universidad Autónoma de la Salud, con el mandato de desarrollar una fuerza de trabajo en salud socialmente responsable y competente, brindar atención médica y realizar actividades de innovación. Investigación en salud. Ubicado en el este de Nepal, el instituto ha ampliado sus servicios de salud continuos mediante la enseñanza de conceptos distritales en varios centros de atención primaria distritales, hospitales distritales y hospitales zonales. La universidad lleva el nombre de Bishweshwar Prasad Koirala, el líder visionario de Nepal en la mejora social y un firme creyente en la unidad nacional.
Este instituto se concibe como un ejemplo exitoso de cooperación Nepal-India. En el auspicioso día hindú de Mahashivaratri (10 de marzo de 1994), los Ministros de Salud de los dos países firmaron el Acuerdo Indo-Nepal para el establecimiento de BPKIHS.
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